Annual Conference sa koná každý rok koncom januára počas siedmich dní. Zúčastňujú sa jej delegáti a koordinátori výmeny zo všetkých krajín, v ktorých IAESTE pôsobí. Počet účastníkov konferencie sa pohybuje medzi 180 – 250. Konferencia pozostáva z viacerých častí:
- Generálna konferencia
- Výmena odborných stáží
- IDT školenie
- Semináre a cvičenia
Hlavným účelom konferencie je stretnutie, diskusia a hlasovanie o záležitostiach týkajúcich sa IAESTE. Hlasovacie právo má vždy len 1 delegát z každej krajiny. Časť "Výmena odborných stáží", ako už samotný názov napovedá, slúži na stretnutie koordinátorov výmeny z každej členskej krajiny. Odborné stáže sa menia medzi krajinami recipročne. Na základe požiadaviek od študentov sa koordinátori výmeny snažia nájsť pre nich tú, ktorá im najviac vyhovuje a pre ktorú spĺňajú kritéria stanovené zamestnávateľom. Základným dorozumievacím jazykom je angličtina, ktorou musia hovoriť všetci účastníci. Miesto konferencie sa volí vždy 2 roky dopredu.
Miesta konania predchádzajúcich konferencií:
- 2015 Záhreb, Chorvátsko
- 2014 Quito, Ekvádor
- 2013 Belfast, Severné Írsko
- 2012 Skopje, Macedónsko
- 2011 Bangkok , Thajsko
- 2010 Zurich, Švajčiarsko
- 2009 Krakow, Poľsko
- 2008 Amman, Jordánsko
- 2007 Lisabon, Portugalsko
- 2006 Valleta, Malta
- 2005 Cartagena de Indias, Columbia
- 2004 Viedeň, Rakúsko
- 2003 Bangkok, Thajsko
- 2002 Trondheim, Nórsko
- 2001 Durban, Juhoafrická republika
- 2000 Washington DC, USA